為了防止儲存期間膜表面生物的生長和在后續操作中性能降低，膜元件被保存在特制的溶液中。

1、新膜元件

（1）通水后保持濕潤狀態。即使是為了確認同一包裝的數量而需暫時打開，也是不損壞塑料袋的條件下進行，此狀態應保存到使用時為止；

（2）盡量保存在5~10℃的低溫下。在溫度超過10℃的環境中要選擇通風良好的場所，避免陽光直射，溫度不要超過35℃；

（3）如果發生凍結就會造成物理破損，所以要采取保溫措施，不要使之凍結；

（4）堆放膜元件時，包裝箱不要超過5層，并要確保紙箱保持干燥。

2、使用過的膜元件

（1）膜元件保持在陰暗的場所，保存溫度不要超過35℃，并且要避免陽光直射；

（2）溫度在0℃以下時會有凍結的風險，所以要采取措施；

（3）為了防止膜元件在短期儲藏、運輸以及系統待機時微生物的滋長，需要用純水或反滲透產水配制濃度500~1,000ppm、pH3~6的亞硫酸氫鈉保護液浸泡元件。

（4）將膜元件放在保存溶液中浸泡大約1小時后，從溶液中取出，并包裝在氧隔離袋中，將袋子密封并貼上標簽，標明包裝日期；

（5）需要保存的膜元件進行重新包裝之后，保存條件與新的膜元件的一致；

（6）保存液的濃度及pH都要保持在上述范圍，需定期檢查，如果可能發生偏離上述范圍時，要再次調制保存液；

（7）無論在何種情況下保存，膜都不能處于干燥狀態。

（8）另外也可以采用濃度為0.2~0.3%甲醛溶液作為保存溶液。甲醛是比亞硫酸氫鈉更強的微生物殺傷劑，并且成分中不含有氧。